Necesitas iniciar desde el CD y en lugar de instalar Windows, seleccionas
reparar, si no tienes CD lo puedes
bajar desde acá.
Finalmente te tendría que salir una pantalla así:
Ahí seleccionas reparar inicio o startup repair y se arregla sólo, los pasos
están acá.
Preguntaba sobre la versión de Windows porque en XP se hace un poco más manual, desde la consola de recuperación.